I Funko Pops li abbiamo descritti con una S in più che vuole segnalare che sono Special. Infatti, questi Funko sono realizzati in edizioni limitate e presentano caratteristiche esclusive, come varianti di colore, abbigliamento specifico o dettagli aggiuntivi.I Funko Pops sono molto ricercati dai collezionisti e spesso diventano veri e propri oggetti da collezione. Tutti questi Funko hanno ovviamente anche un prezzo diverso dal Pop Classico.